维普查重与知网查重在查重算法上存在较大差异。维普查重采用先进的文本比对技术，能够检测出细微的文本相似度，准确性较高。而知网查重虽然也能完成查重任务，但在算法精度和速度上稍显不足。

另外，维普查重和知网查重在覆盖范围上也有所不同。维普查重涵盖的文献资源更为广泛，包括学术期刊、会议论文、学位论文等，而知网查重主要针对学术期刊等少数资源进行查重，覆盖范围相对较窄。综上所述，维普查重与知网查重在算法和覆盖范围等方面存在明显差异。